ESTUDIO PRELIMINAR DE MICROSATELITE ASOCIADO AL GEN SLC11A1 REGIÓN 3´UTR EN RAZAS ADAPTADAS DE PANAMÁ

ESTUDIO PRELIMINAR DE MICROSATELITE ASOCIADO AL GEN SLC11A1 REGIÓN 3´UTR EN RAZAS ADAPTADAS DE PANAMÁ Áxel Villalobos Cortés1, Rita González Herrera2 y Carmen Bieberach Forero1 1

Laboratorio Agrobiotecnología, Instituto de Investigación Agropecuaria de Panamá. El gen de la familia del transportador del soluto (SLC11A1) anteriormente conocido como Proteína de resistencia natural asociada al macrófago bovino (NRAMP), presenta polimorfismos debido a un microsatélite ubicado en la región 3’ UTR. El SLC11A1 ha sido asociado con la susceptibilidad/resistencia a muchos patógenos intracelulares. Este gen codifica un catión transportador divalente localizado en la membrana del fagolisosoma de los macrófagos y se ha demostrado que desempeña un papel importante en la inmunidad innata. En Panamá se han desarrollado trabajos de caracterización genética de las razas criollas Guaymí y Guabalá y siendo que dichas razas se han adaptado durante largo tiempo al ambiente local, la posibilidad de encontrar alelos del gen SLC11A1 que le confieran algún tipo de resistencia a enfermedades es muy alta, por lo tanto el objetivo del siguiente trabajo es localizar el gen SLC11A1 en razas bovinas localmente adaptadas en Panamá. Se realizó el muestreo de pelo de 15 animales Guaymí, 19 Guabalá; 10 Brahman; 10 Senepol y 5 animales cruzados (F1) ½ Pardo Suizo x ½ Brahman. El protocolo de extracción consistió en un método modificado para micro preparaciones en tubos de 250ul. En la reacción de PCR se utilizaron los oligonucleótidos SLC11A1 FW: 5’GGAATGAGTGGGCACAGTGGC-3’ y RV: 5’-CCTTCCAGAACTCCCTCTCCG3’. El producto de PCR fue resuelto en geles de agarosa al 2%, teñidas mediante SYBRSafe® y visualizados en un foto documentador Biodoc-it™ Imagine System de UVP®. Se logró por primera vez en Panamá la amplificación de un fragmento ubicado entre 200 y 300bp en las cinco poblaciones estudiadas. De las muestras amplificadas se lograron secuenciar 35, logrando observar nuevos polimorfismos de las regiones GT’s como el (GT)3, (GT)4 y (GT)5. La repeticiones más comunes entre las poblaciones evaluadas fueron la (GT)11, (GT)6 y (GT)4 con 34.3, 20. 7 y 11.4% respectivamente. Además se encontró la repetición (GT)13 en la raza Guabalá, asociada a la resistencia natural contra la brucelosis y siendo esta misma raza la que mayor polimorfismo en el número de repeticiones se encontró.